Qu'est-ce qu'un script ?
Un script ne correspond pas à la molécule elle-même, celle-ci étant
référencée en "*.pdb" : elle apparaît sous une forme
"brute", sans que telle ou tel élément ait subi de traitement
particulier (affichage différencié des chaînes d'une protéine,
coloration en rouge de toutes les adénines d'un brin d'ADN,
représentation en ruban, en sphère, etc...). Le script correspond à l'
enregistrement de l'ensemble de ces données qui modifient la
représentation d'une molécule. Ils correspondent alors à des fichiers
de type "*.scr" qui viennent s'ajouter en complément de la
molécule "*.pdb".
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Pourquoi sauvegarder un script ?
Quand un mode de représentation est particulièrement intéressant
(met en valeur une fonction précise, etc...) et que son obtention a été
compliquée, il ne sera pas possible aux élèves de travailler à partir
de la molécule brute. Proposer aux élèves une série de scripts
préalablement choisis sera un gain de temps : l'objectif n'étant pas,
pour l'élève, de connaître toutes les fonctionnalités de Rastop, mais
bien d'étudier un molécule en 3 dimension (parce que cette étude
permettra de résoudre un problème en rapport avec le cours).
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